Exilmuseum mieście się aktualnie w tymczasowej siedzibie. Docelowo przeniesie się w okolice dawnego dworca Anhalter, gdy projektowany tam muzealny budynek zostanie ukończony. Główna narracja placówki koncentruje się na latach 1933-1945, gdy na skutek prześladowań przez nazistów, około pół miliona osób opuściło Niemcy, rozpoczynając swoją podróż właśnie z dworca Anhalter.
Muzeum wychodźstwa w Berlinie chce opowiadać historii ludzi, którzy stanęli w obliczu tego losu, budując jednocześnie most ku teraźniejszości i rozważając nad dzisiejszym doświadczaniem przez migrantów i migrantki ucieczki i wykorzenienia.